Nettoyer le code, renommer les dossiers et les variables

Le nettoyage du code comprend:

• le renommage du dossier src en un nom qui soit moins générique => Renommé en gpf_pyroger
• le renommage des variables d'environnement (détaillées dans le ticket JIRA principal)
• déplacer le script mime_api_entrepot.py dans le dossier tests/dev=> cf. MR !10 (closed)
• supprimer les logger.info superflus (anciennement des print() qui ont été transformés en logger.info)